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The Genes We Share

Un robot que sigue los pasos de TODOS los genes de una célula revela patrones claves
Descubriendo cómo cambian a través del tiempo los patrones de actividad génica
Investigadores de levadura ganan la delantera
El microarreglador de ADN
Es fantástico hacer un microarreglador
Día uno: caos y fallas
Día dos: Listo y en funcionamiento
Día tres: Usando los robots
El desarrollo sexual de la levadura
Una idea más precisa sobre el cáncer de mama
Extendiendo los beneficios
El "asombroso poder" de la levadura
Cáncer: El ciclo de división celular de levadura ofrece pistas

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Es fantástico hacer un microarreglador:
Día tres: Usando los robots
 

Sudha Veeraraghavan, Maria Lagerstrom-Fermer, de Suecia, y Vivek Mittal, del Laboratorio de Cold Spring Harbor, se regocijan con el éxito obtenido en una prueba de alineación, utilizada para afinar la instalación del software del impresor.

Ash Alizadeth, uno de los instructores del curso, mira un portaobjeto recién impreso a la luz para inspeccionarlo.

Arul Chinnaiyan y Max Diehn, uno de los instructores del curso, examinan una serie de impresiones de prueba.

James Watson (a la derecha) discute el progreso de los estudiantes con Pat Brown (centro) y Bruce Futcher.

Fotos: Kay Chernush


 
 

Para el tercer día, los participantes estaban amplificando el ADN del genoma completo de levadura. Luego, hicieron turnos para imprimirlo en los portaobjetos de vidrio y para examinar los resultados. "Esto es fantástico", dijo Michael Ryan del Departamento de Salud del Estado de Nueva York, mientras sostenía un portaobjeto a la luz. "¡Es el primero que se imprimió!"

El resto del curso se centró en cómo utilizar las nuevas máquinas. Los estudiantes diseñaron y realizaron varios experimentos. Esparcieron muestras de ADN sobre los puntos impresos en portaobjetos de vidrio para ver donde se uniría el ADN; la unión indicaría que un gen particular estaba expresado en la célula que proporcionaba las muestras. Vieron que los distintos genes cambiaban sus niveles de expresión en distintas circunstancias. Y aprendieron a medir e interpretar estas diferencias, usando un escáner especial para realizar las mediciones y el nuevo software desarrollado por Michael Eisen, experto en bioinformática de Stanford, para identificar patrones en los datos. Eisen, quien ya había puesto su software a disposición de todos los científicos, había venido al Laboratorio de Cold Spring Harbor específicamente para enseñar a los participantes cómo utilizarlo.

Los participantes tenían muchos motivos para querer dominar estas técnicas. "Por lo menos 20 genes están involucrados en la diabetes juvenil, pero no sabemos casi nada de 18 de ellos —sólo conocemos sus regiones generales en los cromosomas—", dijo Michele Marron, del Departamento de Inmunología de la Universidad de Florida. "La mayoría de estas regiones de ADN son muy largas y no contribuyen mucho. Esperamos identificar los genes comparando niveles de expresión génica en ratones normales y diabéticos. También deseamos identificar las vías de los genes".

Christian Kaltschmidt, de la Universidad de Frieburg, en Alemania, quien trabaja en los mecanismos de la memoria, estaba ansioso por encontrar genes que puedan proteger contra la enfermedad de Alzheimer. Matthis Lorenz, del Instituto Nacional del Cáncer en Bethesda, en Maryland, está estudiando el cáncer de mama. Maria Lagerstrom-Fermer, de la Universidad de Uppsala, en Suecia, comparará la actividad génica en las células de pacientes que tienen leucemia mieloide crónica durante y después del tratamiento.

Bruce Futcher del Laboratorio de Cold Spring Harbor utilizará el microarreglador que acaba de construir en el curso, para ampliar su trabajo sobre el ciclo de división celular. En 1998, él colaboró con Paul Spellman, Pat Brown y David Botstein para localizar 800 genes de levadura que son regulados por este ciclo. En este momento, desea estudiar los grupos de genes que son activados, uno tras otro, durante este ciclo, e identificar las funciones de genes individuales en los grupos.

Además de realizar su propia investigación, casi la mitad de los participantes del programa pretenden establecer instalaciones que harán y proveerán de arreglos a otros científicos en sus universidades, hospitales o centros de investigación.

Una vez que se instala un microarreglador, "es muy fácil y barato hacer estas cosas", dice Pat Brown con gran entusiasmo. "¡Se podrían imprimir 100.000 arreglos por año con cuatro máquinas! Es tan rutinario.... Quisiera que lo vieran. Quería asegurarme de que no lo encontraran intimidante".

— Maya Pines


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